Ang pagbabakuna ay ang paglalapat o pag-inject sa ating katawan ng bakuna na mula sa pinahinang uri ng virus o bacteria tulad ng Tigdas, Pertussis atbp. Ito ay upang bumuo ang ating katawan ng sariling panlaban o immunity para sa uri ng sakit na ito. Ang uri ng gamot na ginagamit sa pagbabakuna ay tinatawag na bakuna o vaccine.
Hindi lahat ng uri ng impeksiyon ay maaaring buuin bilang isang bakuna. May mga impeksiyon o sakit na maaaring gawing bakuna, depende sa uri ng virus o bacteria.